黄昏的教堂，会降临沾满鲜血的天使。
拥有蓝色眼睛的少年——狮子堂·塞巴斯蒂安·美弥古。被称为天才去美国留学，几年后。
回国编入高中的他，其实在留学中取得了某种资格。
相隔许久回到日本，美弥古与儿时的玩伴琴理过着平淡无奇的普通生活。而这时与他同居的侦探·雨之森悠却接受了某一事件的调查。用尸体做装饰的奇异连续杀人事件。被叫作《骨天使》杀人事件的调查。
天使，神，罪孽。美弥古沿着错综复杂的线索搜查真相，只是为了保护脆弱的野兽。
事件中真正的黑暗，将会在《庭院式盆景》里揭晓……