故事的主角──拉斐爾．柯迪，是阿拉巴馬州諾科比湖附近的居民，自小熱愛湖畔的自然生態環境，和父親、表哥時常深入叢林裡狩獵探險。在他滿十八歲的那一年，他進入了佛羅里達大學生物系就讀，所鑽研的論文題目正是「螞蟻」。

拉斐爾的母親瑪西雅出身名門望族，在嫁給他父親後，娘家的兄弟姊妹一直很不諒解這樁婚事，瑪西雅也成日鬱鬱寡歡，一直到自己的兒子將以優異成績從佛羅里達大學畢業的那一刻，積壓已久的情緒終於獲得抒發。於是她將拉斐爾帶回自己娘家兄長賽洛斯家裡，希望這位作舅舅的能夠給從小著迷於螞蟻和自然生態的拉斐爾一點生涯規劃。賽洛斯在諾科比周邊從事房地產業，生意頭腦十足，在半威脅半利誘（他答應替小拉斐爾支付念研究所的學費）之下，成功說服外甥以名列前茅的在校成績申請哈佛大學法律系，並要求他必須在畢業之後，從事法律相關工作，暫時揮別心愛的生物研究。

當然，沒有人確切知道拉斐爾心內打著如意算盤，他早已清楚知道自己想要的事物、還有一生最重要的信念是什麼。在哈佛大學就學期間，拉斐爾的經歷活脫脫就是作者威爾森教授青年時的翻版，他歷經遇見初戀、墜入愛河、到因為對環境保育的理念不合而分開；當結束了法律系的學業之後，拉斐爾遵守當年和舅舅賽洛斯的約定，毅然投入家鄉一間大型建設公司擔任法律顧問，而他的主要任務就是擺平公司在開發自然保育區域時與當地居民的衝突。

本書裡每一位角色的個性都是鮮明而立體，除了冷靜、朝理想不斷逼近的拉斐爾之外，也有熱血投入環保抗爭行動的記者，私下進行恐嚇、綁標圍標的地方財閥，擔心自身既得利益受到威脅的宗教份子……。相對於其他生態小說，《蟻丘之歌》的故事性不僅強烈，而且更容易讓讀者在與自身環境相對照之下產生共鳴。