故事的背景设定在明治初期，正当文明开化的时候，这个时期喜欢漫画的都应该知道，没错，就是某疤面剑客决战绷带杀人狂的时候，确切的说，应该是两种文明开始冲突的时候。故事的地点，是已经被无数怪兽、恶魔、机兵袭击过的帝都东京。 仓桥镇（这是人名··）天真的少女，喜欢看书，如果不是因为身体总是发生奇怪的状况，应该是过着平常的生活，可是，镇总是莫名的晕倒，而当她醒来，自己已经远离了原来的地方，而这段时间的记忆，也会完全消失。直到有一天，为了调查离奇事件的密探来到她身边。事情，才渐渐有了眉目。 原来，镇的母亲把具有强大力量的九十九神封在了她的体内，是保护，也是责任而同时，另一伙利用九十九神的人出现了。接着···由命运引导的对抗，开始了