被謎樣地球外有機生命體寄生的少年──空木實用自身的能力「孤獨」當武器，艱辛地戰勝了人類之敵「紅寶石之眼」。
　　那一天，「加速者（Accelerator）」由美子邀請他加入「組織」。組織的職責是撲滅會加害人類的「紅寶石之眼」能力者。受到一起戰鬥的請託後，實答應加入，卻要求了某個交換條件。
　　那就是，消除他自身的「存在」。
　　他不斷追尋著「沒人認識自己」的世界……
　　實的下一個敵人是最危險狡猾的敵人──操縱「氧氣」的「發火者（Igniter）」。
　　懷抱著絕對「孤獨」的少年將何去何從──